2013. december 31., kedd. A tudósok először kezdték meg kombinálni a számítást és a genomikai információkat a meglévő gyógyszerek új felhasználásának előrejelzésére. A Nemzeti Egészségügyi Intézetek (NIH) által finanszírozott számítási tanulmány elemezte a genomi és farmakológiai adatokat, hogy előre jelezze a piacon már megjelenő új gyógyszerhasználatokat. A kutatók, Dr. Atul J. Butte vezetésével, a kaliforniai Stanfordi Egyetemen, a „Science Translator Medicine” legújabb kiadásában két cikkben közölték eredményeiket. "Egy új gyógyszer forgalomba hozatala általában körülbelül egymilliárd dollárba kerül, és sok éves kutatás és fejlesztés" - mondja Dr. Rochelle M. Long, az NIH Pharmacogenomics Research Network igazgatója -, ha találunk módszereket olyan gyógyszerek újbóli felhasználására, amelyek már jóváhagyva, a meglévő kezelések javíthatók és időt és pénzt takaríthatnak meg. "
A tudósok adataikat a Gene Expression Omnibus-ból (a Nemzeti Biotechnológiai Információs Központtól) nyerték, amely egy nyilvános adatbázis, amely több ezer genomikai kutatás eredményeit tartalmazza széles körben, és amelyeket a kutatók világszerte bemutattak.
Butte csoportja 100 betegségre és 164 gyógyszerre összpontosított, és számítógépes programot hozott létre a lehetséges kábítószer-betegség-kombinációk, gyógyszerek és betegségek keresésére, amelyek génexpressziós mintázata egymást kizárja. Például, ha egy betegség növeli bizonyos gének aktivitását, a program megkísérel egyeztetni egy vagy több olyan gyógyszerrel, amelyek csökkentik ezt az aktivitást.
A gyógyszer-betegség sok kombinációja ismert és klinikai alkalmazásban van, megerősítve ennek a megközelítésnek az érvényességét. Például az elemzés helyesen megjósolta, hogy a prednizolon kezelni tudja a Crohn-kórot, amely betegség esetében ez a gyógyszer standard kezelés.
Más kombinációk újszerűek és meglepőek: a fekélyek kezelésére szolgáló gyógyszer (cimetidin) egybeesett a tüdőrákkal, egy antikonvulzáns (topiramát) egybeesett a gyulladásos bélbetegséggel - amely magában foglalja a Crohn-kórot is.
A cimetidin és a tüdőrák kapcsolatának igazolására a csoport a laboratóriumban és az egerekbe implantált sejteken tesztelte ezt a gyógyszert az emberi tüdőrák sejtein. Mindkét esetben a gyógyszer lelassította a rákos sejtek növekedését, összehasonlítva a kontrollcsoporttal (sejtek vagy egerek), amelyek nem kaptak cimetidint.
Annak kipróbálására, hogy az antikonvulzív topiramát hatással van-e a gyulladásos bélbetegségekre, a kutatók a gyógyszert olyan patkányoknak adták be, akiknek ilyen bélbetegség tünetei voltak: hasmenés, gyulladás, fekélyek és a vastagbél mikroszkopikus károsodása. A gyógyszer enyhítette ezeket a tüneteket, néha még jobban, mint a prednizolon.
A tudósok emellett megjegyezték, hogy a hasonló molekuláris folyamatokkal (például azokkal, amelyek érintik az immunrendszert) betegségeket csoportosítottuk az elemzésbe. Ugyanez történt a hasonló hatású gyógyszerekkel (például azok, amelyek lassítják a sejtosztódást). A kutatók úgy vélik, hogy ezen váratlan csoportosulások tanulmányozásával többet megtudhatnak bizonyos betegségek előrehaladásáról és egyes gyógyszerek molekuláris működéséről.
Long szerint "ez a kutatás még mindig korai szakaszban van, de ígéretes módszer egy kreatív, gyors és megfizethető megközelítéshez, amikor új gyógyszer-felhasználásokat fedezünk fel, amelyek már megtalálhatók a terápiás arzenálunkban."
Forrás:
Címkék:
Cut-And-Gyermek Pszichológia hírek
A tudósok adataikat a Gene Expression Omnibus-ból (a Nemzeti Biotechnológiai Információs Központtól) nyerték, amely egy nyilvános adatbázis, amely több ezer genomikai kutatás eredményeit tartalmazza széles körben, és amelyeket a kutatók világszerte bemutattak.
Butte csoportja 100 betegségre és 164 gyógyszerre összpontosított, és számítógépes programot hozott létre a lehetséges kábítószer-betegség-kombinációk, gyógyszerek és betegségek keresésére, amelyek génexpressziós mintázata egymást kizárja. Például, ha egy betegség növeli bizonyos gének aktivitását, a program megkísérel egyeztetni egy vagy több olyan gyógyszerrel, amelyek csökkentik ezt az aktivitást.
A gyógyszer-betegség sok kombinációja ismert és klinikai alkalmazásban van, megerősítve ennek a megközelítésnek az érvényességét. Például az elemzés helyesen megjósolta, hogy a prednizolon kezelni tudja a Crohn-kórot, amely betegség esetében ez a gyógyszer standard kezelés.
Más kombinációk újszerűek és meglepőek: a fekélyek kezelésére szolgáló gyógyszer (cimetidin) egybeesett a tüdőrákkal, egy antikonvulzáns (topiramát) egybeesett a gyulladásos bélbetegséggel - amely magában foglalja a Crohn-kórot is.
A cimetidin és a tüdőrák kapcsolatának igazolására a csoport a laboratóriumban és az egerekbe implantált sejteken tesztelte ezt a gyógyszert az emberi tüdőrák sejtein. Mindkét esetben a gyógyszer lelassította a rákos sejtek növekedését, összehasonlítva a kontrollcsoporttal (sejtek vagy egerek), amelyek nem kaptak cimetidint.
Annak kipróbálására, hogy az antikonvulzív topiramát hatással van-e a gyulladásos bélbetegségekre, a kutatók a gyógyszert olyan patkányoknak adták be, akiknek ilyen bélbetegség tünetei voltak: hasmenés, gyulladás, fekélyek és a vastagbél mikroszkopikus károsodása. A gyógyszer enyhítette ezeket a tüneteket, néha még jobban, mint a prednizolon.
A tudósok emellett megjegyezték, hogy a hasonló molekuláris folyamatokkal (például azokkal, amelyek érintik az immunrendszert) betegségeket csoportosítottuk az elemzésbe. Ugyanez történt a hasonló hatású gyógyszerekkel (például azok, amelyek lassítják a sejtosztódást). A kutatók úgy vélik, hogy ezen váratlan csoportosulások tanulmányozásával többet megtudhatnak bizonyos betegségek előrehaladásáról és egyes gyógyszerek molekuláris működéséről.
Long szerint "ez a kutatás még mindig korai szakaszban van, de ígéretes módszer egy kreatív, gyors és megfizethető megközelítéshez, amikor új gyógyszer-felhasználásokat fedezünk fel, amelyek már megtalálhatók a terápiás arzenálunkban."
Forrás:
